Το τμήμα αυτό λειτουργεί από το 1982 στα πλαίσια της Πνευμονολογικής Κλινικής του ΑΠΘ στο Νοσοκομείο "Γ. Παπανικολάου". Ειναι μια σχετικά αυτόνομη μονάδα και περιλαμβάνει:

Α. Εξωτερικό Ιατρείο, που παρακολουθεί ασθενείς με άσθμα αλλά και άλλες ανοσονολογικές πνευμονοπάθειες από ολόκληρο το βορειολλαδικό χώρο (υπάρχει οργανωμένο αρχείο 5000 ασθενών με μέση προσέλευση 2-3 φορές το χρόνο).
Β. Βιολογικό εργαστήριο, όπου γίνονται IN VIVO εξετάσεις όπως : τα Δερματικά Τεστ, Εισπνευστικές Δοκιμασίες Πρόκλησης με Ισταμίνη, Μεταχολίνη και άλλες ουσίες και IN VITRO εξετάσεις όπως : Ανίχνευση ανοσοσφαιρινών Ε (ολικής και ειδικών), ιζηματινών (υπεύθυνων για αλλεργικές Κυψελιδίτιδες) και ανίχνευση παραγόντων για την εξέλιξη της φλεγμονής των πνευμόνων.
Επίσης, στα τελευταία 13 χρόνια γίνεται και μελέτη των διαμέσων πνευμονοπαθειών με την πλέον σύγχονη μέθοδο της Βρογχοκυψελιδικής `Εκπλυσης (BAL) .
Γ. Αεροβιολογικό εργαστήριο, όπου ανιχνεύονται και καταγράφονται μικροσωματίδια της ατμόσφαιρας που θεωρούνται υπεύθυνα για πρόκληση συμπτωμάτων άσθματος αλλά και άλλων πνευμονοπαθειών. Οι καταγραφές για Γύρεις και Μύκητες γίνονται για περισσότερα απο 17 χρόνια και είναι μοναδικές για την Ελλάδα. Τα στοιχεία αυτά είναι πολύ σημαντικά και αποστέλλονται σε όλους τους σχετικούς διεθνείς οργανισμούς. Ενημερώνεται δε σε εβδομαδιαία Βάση η ΕΤ-3 που εχει και ειδικό δελτιο κυκλοφορίας Γύρεων για αλλεργικούς. Tα ίδια στοιχεία δίδονται και στο Ιντερνετ ( http://www.polleninfo.org ) για χρήση από ενδιαφερόμενους σ' ολόκληρο τον Κόσμο.
Η μονάδα αυτή λειτουργεί με την ευθύνη του κ. Δ.Γκιουλέκα Αναπλ. Καθηγητή του ΑΠΘ και της κ Δ Παπακώστα, Λέκτορα του ΑΠΘ. Σημαντική συμμετοχή επίσης έχουν η Βιολόγος κ. Θ. Πολυζώνη, η Νοσηλεύτρια κ. Λ.Τζερεμέ και ο κ Θ. Δάμιαλης, Δασολόγος-Περιβαλλοντολόγος. Στενή όμως συνεργασία υπάρχει με άλλα τμήματα του ΑΠΘ, όπως Μετεωρολογίας, Βιολογίας, Γεωπονίας. Επίσης στενή συνεργασία υπάρχει και με κέντρα του εξωτερικού, όπως το Πανεπιστήμιο Leiden Ολλανδίας (κ. F.Th.Spieksma), Πανεπιστήμιο Βιέννης (κ. S. Jeager), Πανεπιστήμιο Στοκχόλμης (κ.S. Nilsson) .
Από την μονάδα αυτή έχουν εκπονηθεί 10 διδακτορικές διατριβές και βρίσκονται σε εξέλιξη άλλες 3.